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--- specialspatial [2017/02/16 15:19]
glaroc [Importer des données de QGIS dans PostGIS]
+++ specialspatial [2017/02/20 16:59] (current)
glaroc [Exercice 6]
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 ====== Atelier du CSBQ sur l'utilisation des logiciels libres pour l'analyse spatiale avancée. ======
-avril 2015, Université McGill, Montréal.
+février 2017, Université du Québec à Rimouski.
   * [[https://prezi.com/gtw8-gwn8gqt/atelier-du-csbq-sur-lutilisation-des-logiciels-libres-pour-lanalyse-spatiale-avancee/|Lien vers la présentation Prezi]]
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 Then type
 <file>
-sudo gedit /etc/postgresql/9.3/main/postgresql.conf
+sudo gedit /etc/postgresql/9.5/main/postgresql.conf
 </file>
 enlevez le # devant #listen_addresses = 'localhost'
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   - Assurez-vous que l'extension DB Manager est activée dans la liste des extensions (plugins).
   - Allez à Database... DB Manager. Cliquez sur PostGIS et naviguez vers la base de données spatiales (spatialdb) que vous avez créé plus tôt.
-  - Cliquez sur l'icône Import Layer/File et choisissez le fichier "obis_toothed_whales.shp". Choisissez "Create spatial index" et laissez les autres options inchangées. Nommez la nouvelle table "obis_whales" en minuscules. Souvenez-vous que les noms de tables PostgreSQL ne devraient jamais inclure de lettres majuscules, d'espaces, de caractères spéciaux ou d'accents.
+  - Cliquez sur l'icône Import Layer/File et choisissez le fichier "obis_toothed_whales.shp". Choisissez "Create spatial index" et "Create single-part geometries instead of multi-part" et laissez les autres options inchangées. Nommez la nouvelle table "obis_whales" en minuscules. Souvenez-vous que les noms de tables PostgreSQL ne devraient jamais inclure de lettres majuscules, d'espaces, de caractères spéciaux ou d'accents.
   - Répétez ces étapes pour importer EEZ_IHO_union_V2.shp (nommez là eez_iho), meow_ecos.shp (nommez là meow) et TM_WORLD_BORDERS.shp (nommez là tm_world).
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 Extraire les latitudes et longitudes de chaque occurrence de "Delpinus delphis". Note: nous devons utiliser une sous-requête et la fonction ST_Dump dans ce cas car les occurrences d'odontocètes ont été importées en format MULTIPOINT et les fonctions ST_X/ST_Y exigent des POINT.
 <file postgresql>
-SELECT ST_X(geom), ST_Y(geom) FROM (SELECT (ST_Dump(geom)).geom  FROM obis_whales WHERE tname='Delphinus delphis') a
+SELECT ST_X(geom), ST_Y(geom) FROM obis_whales WHERE tname='Delphinus delphis';
-</file>
-Nous pouvons créer une colonne de type POINT au lieu de MULTIPOINT
-<file postgresql>
-ALTER TABLE obis_whales ADD COLUMN geompt GEOMETRY(POINT,4326);
-UPDATE obis_whales SET geompt=(ST_Dump(geom)).geom;
 </file>
 Distance au plus proche voisin pour chaque localisation de béluga
 <file postgresql>
-SELECT DISTINCT ON(a.id_0) a.id_0, b.id_0 as nn, ST_Distance(a.geom,b.geom) as dist FROM obis_whales a, obis_whales b WHERE a.id_0 <> b.id_0 AND a.tname='Delphinapterus leucas' AND b.tname='Delphinapterus leucas' ORDER BY a.id_0,dist
+SELECT DISTINCT ON(a.id) a.id, b.id as nn, ST_Distance(a.geom,b.geom) as dist FROM obis_whales a, obis_whales b WHERE a.id <> b.id AND a.tname='Delphinapterus leucas' AND b.tname='Delphinapterus leucas' ORDER BY a.id,dist
 </file>
-**EXERCICE 1** Trouvez le pays qui a la plus gros ratio entre son la racine carrée de son aire et son périmètre. Quel pays a le plus petit ratio?
+**EXERCICE 1** Trouvez le pays qui a la plus gros ratio entre la racine carrée de son aire et son périmètre. Quel pays a le plus petit ratio?
 ++++ Réponse |
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-===== Utilisation de PostGIS et GRASS dans R =====
+===== Utilisation de PostGIS, QGIS et GRASS dans R =====
 {{::special_spatial_code_r.r|Téléchargez le fichier R contenant le code pour cette partie de l'atelier}}.
+  * Package [[http://cran.r-project.org/web/packages/RQGIS/index.html|RQGIS]]
   * Package [[http://cran.r-project.org/web/packages/spgrass6/index.html|spgrass6]]
   * Package [[http://cran.r-project.org/web/packages/RPostgreSQL/index.html|RPostgreSQL]]
   * Package [[http://cran.r-project.org/web/packages/rgdal/index.html|rgdal]]
 ===== Utilisation de Processing dans QGIS =====
-  * [[http://docs.qgis.org/2.6/en/docs/training_manual/processing/index.html|QGIS Training manual. Processing Guide. ]]
+  * [[http://docs.qgis.org/2.14/fr/docs/training_manual/processing/index.html|QGIS Training manual. Guide du module Traitements. ]]
-  * [[http://docs.qgis.org/2.6/en/docs/user_manual/processing/index.html|QGIS User manual - Processing framework.]]
+  * [[http://docs.qgis.org/2.14/en/docs/user_manual/processing/index.html|QGIS User manual - Processing framework.]]
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 - Ajoutez "Extract by attributes" au modèle (sous QGIS geoalgorithms). Spécifiez "Pays" comme "Input Layer", = comme opérateur, NAME comme "Selection Attribute" et "Nom du pays" comme "Value".
-- Ajoutez un "Fixed Distance Buffer" au modèle. Spécifiez "Output from Extract by Attributes" comme "Input", et mettre la distance à 0.5 (c'est en degrés puisque la carte est en degrés). Choisissez de "dissolve the output".
+- Ajoutez un "Fixed Distance Buffer" au modèle. Spécifiez "Extracted (attribute)" comme "Input", et mettre la distance à 0.5 (c'est en degrés puisque la carte est en degrés). À "dissolve the output", choisissez 'No'.
 - Ajoutez un autre vecteur au modèle. Nommez-le "Zones". Spécifiez "Polygon" comme "shape type".
-- Ajoutez "Intersection" au modèle. Spécifiez une intersection entre "output of the Buffer" et la couche "Zones".
+- Ajoutez "Intersection" au modèle. Spécifiez une intersection "output of the Buffer" comme Input et  "Zones" comme couche d'intersection.
-- Ajoutez Field Calculator au modèle. Spécifiez new_area comme "Result Field Name" et $area comme Formule. Ceci calculera l'aire des polygones de chaque section de mer dans la zone tampons autour du pays en degrés.
+- Ajoutez Field Calculator au modèle. Spécifiez Intersection comme Input. Spécifiez new_area comme "Result Field Name" et $area comme Formule. Ceci calculera l'aire des polygones de chaque section de mer dans la zone tampons autour du pays en degrés.
 - Maintenant, ajoutez le script R créé plus haut à l'étape 2 au modèle. "Input" est la sortie de l'étape 11 (Field Calculator). Appelez le fichier sortant "Pays_Mers"
 Votre modèle devrait ressembler à ceci:
+{{::graphical_modeler3_processing.png?direct&200|}}
-{{::graphical_modeler1.png?direct&200|}}
-- Vous êtes maintenant prêt à rouler le modèle! Sauvez d'abord le modèle et appelez le Pays_mers. Ensuite, fermez le "Graphical Modeler" et double-cliques sur votre modèle dans le Toolbox sous Models. Spécifiez TM_World_Borders comme Pays and EEZ_IHO_union_v2 Pour les Zones. Spécifiez le nom d'un pays de votre choix (ex. Canada).
+- Vous êtes maintenant prêt à rouler le modèle! Sauvez d'abord le modèle et appelez le Pays_mers. Ensuite, fermez le "Graphical Modeler" et double-cliquez sur votre modèle dans le Toolbox sous Models. Spécifiez TM_World_Borders comme Pays and EEZ_IHO_union_v2 Pour les Zones. Spécifiez le nom d'un pays de votre choix (ex. France).
-- Quand l’algorithme cesse de rouler, vous devriez vois un graphique montrant l'aire de chanque mer le long de la côte du pays choisi.
+- Quand l’algorithme cesse de rouler, vous devriez voir un graphique montrant l'aire de chaque mer le long de la côte du pays choisi.