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r_symposium_2019_t [2019/09/13 14:56]
ph.pereirabraga
r_symposium_2019_t [2019/09/19 14:45] (current)
ph.pereirabraga
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-Les inscriptions pour le 3ème Colloque R du CSBQ sont **OUVERTES**.+Les inscriptions pour le 3ème Colloque R du CSBQ sont **OUVERTES**. ​\\ 
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 +**[[https://​registration.qcbs.ca/​fr/​colloque-r-2019|INSCRIVEZ-VOUS MAINTENANT!]]** 
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-Registration for the 3rd QCBS R Symposium is **OPEN**.+Registration for the 3rd QCBS R Symposium is **OPEN**.\\ 
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 +**[[https://​registration.qcbs.ca/​r-symposium-2019|REGISTER NOW!]]**
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 === Basics of effective and reproducible data visualization === === Basics of effective and reproducible data visualization ===
-//par// | //by// **Tania Maxwell** (Université Laval)+//par// | //by// **Tania Maxwell** (Université Laval  | [[https://​twitter.com/​tania_maxwell7|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]]) 
  
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 === Touchdown your research! === === Touchdown your research! ===
-//par// | //by// **Steve Vissault** (Université de Sherbrooke) & **Marie-Hélène Brice** (Université de Montréal)+//par// | //by// **Steve Vissault** (Université de Sherbrooke ​| [[https://​github.com/​SteveViss|{{https://​github.githubassets.com/​images/​modules/​logos_page/​GitHub-Mark.png?​25x25}}]] | [[https://​twitter.com/​SVissault|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]]) & **Marie-Hélène Brice** (Université de Montréal ​| [[https://​github.com/​mhbrice|{{https://​github.githubassets.com/​images/​modules/​logos_page/​GitHub-Mark.png?​25x25}}]] | [[https://​twitter.com/​mariehbrice|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]]) 
  
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-=== Community Phylogenetics:​ linking community ecology and evolutionary biology to your skills ​in R === + 
-//par// | //by// **Pedro Henrique P. Braga** (Concordia University) & **Katherine Hébert** (Université de Sherbrooke)+=== Mining species-level biodiversity information from published literature === 
 +//par// | //by// **Gabriel Muñoz** (Concordia University | [[https://​github.com/​fgabriel1891|{{https://​github.githubassets.com/​images/​modules/​logos_page/​GitHub-Mark.png?​25x25}}]] | [[https://​twitter.com/​NasuaResearch|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]]) 
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 +À cause de plusieurs siècles de recherche, de nombreuses informations sur la vie sur notre planète sont enregistrées dans la littérature publiée sur le Web. La plupart de cette littérature est maintenant accessible et se présente sous forme d'​articles,​ de thèses ou de rapports, stockés et partagés sous forme de fichiers PDF. Cependant, numériser individuellement et manuellement tout ce contenu pour séparer et extraire des données sur la biodiversité peut être une tâche ardue. Avec cet atelier, vous allez apprendre des outils informatiques et des moyens plus automatisés pour rechercher de l’information sur la biodiversité parmi la littérature publiée. Nous commencerons par examiner brièvement les différentes sources de documentation sur la biodiversité. Deuxièmement,​ nous explorerons les techniques programmatiques pour la recherche documentaire et la sélection de mots-clés. Troisièmement,​ nous allons apprendre à utiliser des outils spécifiques pour extraire des observations de la biodiversité à partir d’une collection d’articles en PDF. Enfin, nous allons réviser brièvement les agrégateurs globaux de données sur la biodiversité. 
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 +Product of centuries of research, a vast amount of information about life on our planet is stored in the published literature on the web. Most of this literature is now accessible and comes as articles, theses, or reports, which are stored and shared as PDF files. However, manually scanning all this corpus to separate and extract species-level biodiversity data from individual works can be a daunting task. With this workshop, you will learn computational tools and more automated ways to search for biodiversity information of interest among the large corpus of literature. First, we will briefly review common and less-common sources of literature on biodiversity. Second, we will explore techniques of programmatic literature search and selection of keywords. Third, we will learn the use of specific tools to mine particular biodiversity observations from a collection of pdf articles. Finally, we will briefly review common global biodiversity data aggregators. 
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 +=== Community Phylogenetics:​ linking community ecology and evolutionary biology to your programming ​skills === 
 +//par// | //by// **Pedro Henrique P. Braga** (Concordia University ​| [[https://​github.com/​pedrohbraga|{{https://​github.githubassets.com/​images/​modules/​logos_page/​GitHub-Mark.png?​25x25}}]] | [[https://​twitter.com/​pedrohp_braga|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]]) & **Katherine Hébert** (Université de Sherbrooke ​| [[https://​github.com/​katherinehebert|{{https://​github.githubassets.com/​images/​modules/​logos_page/​GitHub-Mark.png?​25x25}}]] | [[https://​twitter.com/​hebert_kat|{{https://​img.icons8.com/​android/​24/​000000/​twitter.png?​22x22}}]])
  
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-=== And, other two workshops ​to come! ===+=== And, another workshop ​to come! ===
  
 ===== Call for Workshop Proposals | Appel à la proposition d'​ateliers ===== ===== Call for Workshop Proposals | Appel à la proposition d'​ateliers =====